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中外科学家成功绘制达尔文雀基因组图谱

2012/8/28 11:22:48 | 1811次浏览
  “万种脊椎动物基因组计划”(G10K)联盟和华大基因近日联合宣布,勇地雀基因组图谱绘制完成。这是双方合作完成的首个可在UCSC基因组数据库中获取的脊椎动物基因组。专家表示,达尔文雀的表型多样性是达尔文进化论的典型例子。本研究将有助于对生活在同一岛屿上的具有丰富遗传多样性的近缘物种基因组进行研究,了解这些物种的遗传学和性状进化机制。
  勇地雀是最早由达尔文记载的生活在加拉帕戈斯群岛上的13种达尔文雀之一,是研究进化的绝佳模型,可使科学家从基因组水平上实时研究这些奇异物种的进化性变化。在雀类中,正向选择突变的基因可能与发声学习性状相关,同时也是人类语言行为中所必需的。此前,科研人员已对斑马雀的发声学习进化机制进行过研究,它们仅有一种固定的发声学习模式;而勇地雀却存在几种不同的鸣叫方式。研究人员推测,这些差异可能 是由遗传调控机制所导致的。

  目前,勇地雀的鸣叫记录已有40余载,这使人们可以更好地了解与发声学习相关的遗传学机制。这些记录所揭示的口音模式与现存和过去群体中的基因组信息相关联,如同人类语言一样。勇地雀鸣叫的不同口音可以逐代相传,但也可以随着迁徙而发生改变。此次勇地雀基因 组的绘制完成,使科学家们能够更好地判定勇地雀的文化演进是部分受到遗传影响还是单纯的文化交流。

  华大基因张国捷介绍:“此次采用新一代测序技术对一只雌性勇地雀进行测序,获得了高质量的基因组图谱,其基因组大小约为人类基因组的1/3。另外,结合转录组数据,对该基因组进行了注释,获得16286个蛋白质编码基因。”目前,勇地雀基因组数据发表在UCSC基因组数据库、《GigaScience》杂志及其GigaDB数据库上。